refactor(joinir): Phase 287 P6 - Remove scan stage (2-stage pipeline)

docs/development/current/main/phases/phase-287/P6-SCAN_PLAN-INTEGRATION-INSTRUCTIONS.md

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 # Phase 287 P6: Scan plan 統合（docs-first, 意味論不変の範囲で）
 
 **Date**: 2025-12-27  
-**Status**: Ready（next）  
-**Scope**: `merge/instruction_rewriter.rs` の Stage 1（scan）で生成する `RewritePlan` を、Stage 2（plan）へ “同じ意味” で反映するか、または Stage 1 を削除して pipeline を単純化するための判断を docs で固定する。  
+**Status**: Completed ✅  
+**Scope**: `merge/instruction_rewriter.rs` の Stage 1（scan）を削除して pipeline を 2-stage（Plan→Apply）へ単純化する（意味論不変）。  
 **Non-goals**: 挙動変更、ログ恒常増加、silent fallback 追加、テスト専用の暫定コード追加
 
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   - debug/log の恒常出力差を出さない（既存 `debug` フラグに従う）
   - pipeline の見通し（責務）を docs と module 構造で補強する
 
+**Decision（2025-12-27）**: Option B を採用する。
+
+理由:
+- Stage 2（Plan）は boundary/local map/PHI/tailcall/terminator を扱っており、Scan を“本当に使う”には Scan 側に情報を増殖させやすい。
+- Scan が未使用のまま残るのは二重修正の温床なので、先に削除して 2-stage へ収束させるのが最も構造的に安全。
+
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 ## 手順（docs-first）