feat: Phase 2.4 レガシーアーカイブ整理完了（151MB削減）

## 🎉 完了項目
- ✅ plugin_box_legacy.rs削除（7.7KB、参照ゼロ確認済み）
- ✅ REMOVEDコメント整理（encode.rs簡潔化）
- ✅ venv削除（143MB節約、.gitignoreは既存）
- ✅ llvm_legacyスタブ化（8KB、compile_error!による安全化）

## 🏆 成果
- **リポジトリサイズ改善**: 151MB削減
- **コード整理**: レガシーコード安全にアーカイブ
- **プラグインファースト**: StrictPluginFirst継続動作

## ✅ 検証完了
- cargo build --release --features llvm (警告のみ、エラーなし)
- LLVMハーネス実行: print出力正常
- プラグイン動作: StringBox等正常動作

codex先生の戦略に従った安全な段階的削除を実行

Co-Authored-By: codex <noreply@anthropic.com>

src/cli/args.rs

@@ -42,7 +42,7 @@ pub fn build_command() -> Command {
         .arg(Arg::new("json-file").long("json-file").value_name("FILE").help("Read Ny JSON IR v0 from a file and execute via MIR Interpreter"))
         .arg(Arg::new("emit-mir-json").long("emit-mir-json").value_name("FILE").help("Emit MIR JSON v0 to file and exit"))
         .arg(Arg::new("emit-exe").long("emit-exe").value_name("FILE").help("Emit native executable via ny-llvmc and exit"))
-        .arg(Arg::new("emit-exe-nyrt").long("emit-exe-nyrt").value_name("DIR").help("Directory containing libnyrt.a (used with --emit-exe)"))
+        .arg(Arg::new("emit-exe-nyrt").long("emit-exe-nyrt").value_name("DIR").help("Directory containing libnyash_kernel.a (used with --emit-exe)"))
         .arg(Arg::new("emit-exe-libs").long("emit-exe-libs").value_name("FLAGS").help("Extra linker flags for ny-llvmc when emitting executable"))
         .arg(Arg::new("stage3").long("stage3").help("Enable Stage-3 syntax acceptance for selfhost parser").action(clap::ArgAction::SetTrue))
         .arg(Arg::new("ny-compiler-args").long("ny-compiler-args").value_name("ARGS").help("Pass additional args to selfhost child compiler"))