feat: Add dual-mode design doc and VM/MIR improvements

- Add comprehensive dual-mode design document (script vs application mode)
- Update phase 9.8 documentation with implementation progress
- Enhance VM with improved error handling and debugging
- Add MIR verification improvements
- Add test cases for MIR/VM POC

🤖 Generated with Claude Code

Co-Authored-By: Claude <noreply@anthropic.com>

docs/development/roadmap/phases/phase-9/phase_9_8_bid_registry_and_codegen.md

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 目的（What/Why）
 - 外部ライブラリをBox（BID）として配布・発見・利用するための基盤を用意する。
-- BID（Box Interface Definition）から各ターゲット（WASM/VM/LLVM/TS/Python）のスタブや宣言を自動生成し、開発者の負担を最小化する。
+- 当面は nyash.toml にBID情報を“埋め込む”方式で回し、将来は外部BID(manifest)参照＋自動生成へ段階拡張する。
 
 成果物（Deliverables）
 - BIDレジストリ仕様（YAML/JSON スキーマ定義・バージョニング・依存関係・権限メタ）
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   - TypeScript/Python: ラッパ（FFI呼び出しAPIのプロキシ）
 - サンプルBIDからの生成例（console/canvas）
 
-範囲（Scope）
-1) スキーマ
-   - `version`, `interfaces[]`, `methods[]`, `params`, `returns`, `effect`, `permissions`（9.9の権限連携）
-   - 例: `docs/nyir/bid_samples/console.yaml`, `docs/nyir/bid_samples/canvas.yaml`
-2) CLI
-   - `nyash bid gen --target <t> <bid.yaml>` → `out/<t>/<name>/...` に生成
-   - オプション: `--out`, `--force`, `--dry-run`
-3) テンプレート
-   - 各ターゲット用のMustache/Handlebars相当のテンプレート群
-4) ドキュメント
-   - `docs/予定/native-plan/box_ffi_abi.md` にBID→生成の流れを追記
+範囲（Scope：段階的）
+A) すぐやる（埋め込みBID）
+   - nyash.toml に最小BID情報（署名・効果・権限）を記述し、ランタイムローダが読み込む
+   - ExternCall/Plugin呼び出し時にBIDの`effects/permissions`を参照して実行可否を判定
+B) 次にやる（参照BID）
+   - nyash.toml から外部BID（bid.yaml 等）を参照・マージ可能にする（アグリゲータ）
+C) 自動生成（安定後）
+   - CLI: `nyash bid gen --target <t> <bid.yaml>` → `out/<t>/<name>/...` に生成
+   - テンプレート: WASM(importObject), VM(関数テーブル), LLVM(declare), TS/Python(RTEラッパ)
+   - ドキュメント: `docs/予定/native-plan/box_ffi_abi.md` にBID→生成の流れを追記
 
-受け入れ基準（Acceptance）
-- console/canvas のBIDから、WASM/VM/LLVM/TS/Python の最小スタブが生成される
-- 生成物を用いて、9.7 のE2E（console.log / canvas.fillRect）が通る
-- `--dry-run` で生成前にプレビューが確認できる
+受け入れ基準（Acceptance：段階的）
+- A: nyash.toml の BID 情報だけでランタイム実行・権限判定が可能（外部BIDなしでも動作）
+- B: 外部BID(manifest)を nyash.toml から参照・マージできる
+- C: console/canvas のBIDから、WASM/VM/LLVM/TS/Python の最小スタブが生成される（`--dry-run` 対応）
 
 非スコープ（Out of Scope）
 - 高度な最適化生成、双方向同期、型高級機能（ジェネリクス/オーバーロード）
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 - 計画: `docs/予定/native-plan/copilot_issues.txt`（9.7/9.8/9.9）
 
 メモ（運用）
+- 対応する形式が増えたら、まず nyash.toml にBIDを追記（“その都度対応”の方針）
 - 将来的に「BID→RuntimeImports/ExternCall宣言」の自動接続まで拡張予定（WASM/VM/LLVM）。
 - 権限メタ（permissions）は 9.9 のモデルに合わせて必須化を検討。
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