feat: スモークテストv2実装＆Phase 15.5後のプラグイン対応

Phase 15.5 Core Box削除後の新テストシステム構築：

## 実装内容
- スモークテストv2システム完全実装（3段階プロファイル）
- 共通ライブラリ（test_runner/plugin_manager/result_checker/preflight）
- インタープリター層完全削除（約350行）
- PyVM重要インフラ特化保持戦略（JSON v0ブリッジ専用）
- nyash.tomlパス修正（13箇所、プラグイン正常ロード確認）

## 動作確認済み
- 基本算術演算（+, -, *, /）
- 制御構文（if, loop, break, continue）
- 変数代入とスコープ
- プラグインロード（20個の.soファイル）

## 既知の問題
- StringBox/IntegerBoxメソッドが動作しない
  - オブジェクト生成は成功するがメソッド呼び出しでエラー
  - Phase 15.5影響でプラグイン実装が不完全な可能性

## ドキュメント
- docs/development/testing/smoke-tests-v2.md 作成
- docs/reference/pyvm-usage-guidelines.md 作成
- CODEX_QUESTION.md（Codex相談用）作成

🤖 Generated with Claude Code

Co-Authored-By: Claude <noreply@anthropic.com>

src/mir/builder.rs

@@ -403,25 +403,10 @@ impl MirBuilder {
             box_type: class.clone(),
             args: arg_values.clone(),
         })?;
-        // Annotate primitive boxes
-        match class.as_str() {
-            "IntegerBox" => {
-                self.value_types.insert(dst, super::MirType::Integer);
-            }
-            "FloatBox" => {
-                self.value_types.insert(dst, super::MirType::Float);
-            }
-            "BoolBox" => {
-                self.value_types.insert(dst, super::MirType::Bool);
-            }
-            "StringBox" => {
-                self.value_types.insert(dst, super::MirType::String);
-            }
-            other => {
-                self.value_types
-                    .insert(dst, super::MirType::Box(other.to_string()));
-            }
-        }
+        // Phase 15.5: Unified box type handling
+        // All boxes (including former core boxes) are treated uniformly as Box types
+        self.value_types
+            .insert(dst, super::MirType::Box(class.clone()));
 
         // Record origin for optimization: dst was created by NewBox of class
         self.value_origin_newbox.insert(dst, class.clone());